莲子生吃的功效包括补脾止泻、养心安神等，对脾虚泄泻、带下量多、遗精滑精、遗尿尿频、心悸失眠、怔忡健忘等有治疗作用。此外，莲子还可以清热降火，可有效避免因上火爆痘的发生，还可以减少黑色素的堆积，从而淡化色斑、雀斑等，从而使皮肤白嫩，有弹性，光滑等。

需要注意的是，莲子毕竟长于水中，多少还是带了一些水中的阴寒之气，对于一般人来说，它微弱得可以忽略不计，但对于本身体质虚寒的人来说，就会有影响。所以唐代著名的食疗专家孟诜说，“生食过多，微动冷气胀人”。